安徽工程大学学生会是校党委领导、校团委指导下的学生组织，现为中华全国学联会员单位、安徽省学联主席团单位，并接受其指导和监督。各院学生会接受校学生会的指导和监督，校院两级学生会共同构成联系全校同学的桥梁和纽带。校学生会由办公室、网络宣传部、学风建设部、实践服务部、文化体育部、权益发展部六个部门组成。每个部门各司其职，又紧紧地团结在一起，让这个大家庭得以更好地服务同学。